MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parainfluenzae T3T1

Total Repeats: 43377

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015964	TCGTA	2	10	43	52	20 %	40 %	20 %	20 %	345428591
2	NC_015964	GCA	2	6	59	64	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428591
3	NC_015964	TGA	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428591
4	NC_015964	CTG	2	6	333	338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428591
5	NC_015964	A	6	6	344	349	100 %	0 %	0 %	0 %	345428591
6	NC_015964	GTG	2	6	396	401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345428591
7	NC_015964	CTT	2	6	444	449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428591
8	NC_015964	TAC	2	6	451	456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428591
9	NC_015964	GTT	2	6	482	487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428591
10	NC_015964	A	6	6	549	554	100 %	0 %	0 %	0 %	345428591
11	NC_015964	GTG	2	6	585	590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345428591
12	NC_015964	GTG	2	6	594	599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345428591
13	NC_015964	CAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428591
14	NC_015964	AGT	2	6	850	855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428591
15	NC_015964	TGATGC	2	12	895	906	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345428591
16	NC_015964	CAAA	2	8	972	979	75 %	0 %	0 %	25 %	345428591
17	NC_015964	A	6	6	1033	1038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015964	T	7	7	1061	1067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015964	TA	3	6	1100	1105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015964	ATA	2	6	1141	1146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015964	TAT	2	6	1151	1156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015964	ATA	2	6	1175	1180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015964	ATTT	2	8	1200	1207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015964	GTT	2	6	1226	1231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015964	CAG	2	6	1286	1291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428592
26	NC_015964	CAA	2	6	1370	1375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428592
27	NC_015964	CTTG	2	8	1403	1410	0 %	50 %	25 %	25 %	345428592
28	NC_015964	CAA	2	6	1535	1540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428592
29	NC_015964	ATTT	2	8	1546	1553	25 %	75 %	0 %	0 %	345428592
30	NC_015964	TGTT	2	8	1578	1585	0 %	75 %	25 %	0 %	345428592
31	NC_015964	A	6	6	1644	1649	100 %	0 %	0 %	0 %	345428592
32	NC_015964	GATG	2	8	1774	1781	25 %	25 %	50 %	0 %	345428592
33	NC_015964	ATC	2	6	1793	1798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428592
34	NC_015964	TCA	2	6	1858	1863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428592
35	NC_015964	CTTT	2	8	1913	1920	0 %	75 %	0 %	25 %	345428592
36	NC_015964	T	6	6	1918	1923	0 %	100 %	0 %	0 %	345428592
37	NC_015964	GAGC	2	8	1943	1950	25 %	0 %	50 %	25 %	345428592
38	NC_015964	TG	3	6	2049	2054	0 %	50 %	50 %	0 %	345428592
39	NC_015964	A	6	6	2073	2078	100 %	0 %	0 %	0 %	345428592
40	NC_015964	GAT	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428592
41	NC_015964	A	6	6	2189	2194	100 %	0 %	0 %	0 %	345428592
42	NC_015964	TTC	2	6	2201	2206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428592
43	NC_015964	ATG	2	6	2282	2287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428592
44	NC_015964	TGG	2	6	2293	2298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345428592
45	NC_015964	AACC	2	8	2310	2317	50 %	0 %	0 %	50 %	345428592
46	NC_015964	TTC	2	6	2327	2332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428592
47	NC_015964	CAT	2	6	2408	2413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428592
48	NC_015964	GGC	2	6	2492	2497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345428592
49	NC_015964	TGA	2	6	2502	2507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428592
50	NC_015964	AGA	2	6	2527	2532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428592
51	NC_015964	ATTT	2	8	2604	2611	25 %	75 %	0 %	0 %	345428592
52	NC_015964	ACCG	2	8	2615	2622	25 %	0 %	25 %	50 %	345428592
53	NC_015964	TGA	2	6	2634	2639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428592
54	NC_015964	AT	3	6	2671	2676	50 %	50 %	0 %	0 %	345428592
55	NC_015964	ATT	2	6	2720	2725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428592
56	NC_015964	A	6	6	2735	2740	100 %	0 %	0 %	0 %	345428592
57	NC_015964	AGA	2	6	2779	2784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428592
58	NC_015964	A	6	6	2792	2797	100 %	0 %	0 %	0 %	345428592
59	NC_015964	ATT	2	6	2846	2851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428592
60	NC_015964	GAA	2	6	2911	2916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428592
61	NC_015964	CT	3	6	2927	2932	0 %	50 %	0 %	50 %	345428592
62	NC_015964	ATT	2	6	3014	3019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428592
63	NC_015964	CAA	3	9	3034	3042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428592
64	NC_015964	A	6	6	3066	3071	100 %	0 %	0 %	0 %	345428592
65	NC_015964	CTA	2	6	3126	3131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428593
66	NC_015964	T	6	6	3187	3192	0 %	100 %	0 %	0 %	345428593
67	NC_015964	CAA	2	6	3238	3243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428593
68	NC_015964	ACC	2	6	3244	3249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428593
69	NC_015964	GGTT	2	8	3330	3337	0 %	50 %	50 %	0 %	345428593
70	NC_015964	TCT	2	6	3368	3373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428593
71	NC_015964	TAA	2	6	3382	3387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428593
72	NC_015964	TGC	2	6	3541	3546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428593
73	NC_015964	T	6	6	3583	3588	0 %	100 %	0 %	0 %	345428593
74	NC_015964	AGT	2	6	3595	3600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428593
75	NC_015964	ACC	2	6	3781	3786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428593
76	NC_015964	TGG	2	6	3811	3816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345428593
77	NC_015964	TTA	2	6	3821	3826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428593
78	NC_015964	GCA	2	6	3902	3907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428593
79	NC_015964	ATC	2	6	3928	3933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428593
80	NC_015964	GAA	2	6	3946	3951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428593
81	NC_015964	GCA	2	6	3998	4003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428593
82	NC_015964	CAACCT	2	12	4100	4111	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015964	CTT	2	6	4179	4184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015964	TCA	2	6	4312	4317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428594
85	NC_015964	TCT	2	6	4366	4371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428594
86	NC_015964	CCAA	2	8	4383	4390	50 %	0 %	0 %	50 %	345428594
87	NC_015964	AAT	2	6	4428	4433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428594
88	NC_015964	CTT	2	6	4460	4465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428594
89	NC_015964	AGT	2	6	4482	4487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428594
90	NC_015964	TCT	2	6	4510	4515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428594
91	NC_015964	CCA	2	6	4562	4567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428594
92	NC_015964	T	6	6	4584	4589	0 %	100 %	0 %	0 %	345428594
93	NC_015964	TAA	2	6	4662	4667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428594
94	NC_015964	T	7	7	4687	4693	0 %	100 %	0 %	0 %	345428594
95	NC_015964	TAA	2	6	4695	4700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428594
96	NC_015964	AAACG	2	10	4702	4711	60 %	0 %	20 %	20 %	345428594
97	NC_015964	CACGCA	2	12	4715	4726	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	345428594
98	NC_015964	TCA	2	6	4744	4749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428594
99	NC_015964	ACA	2	6	4763	4768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428594
100	NC_015964	TCA	2	6	4822	4827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428594
101	NC_015964	TCG	2	6	4867	4872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428594
102	NC_015964	AG	3	6	4899	4904	50 %	0 %	50 %	0 %	345428594
103	NC_015964	TAC	2	6	4958	4963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428594
104	NC_015964	TTC	2	6	4968	4973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428594
105	NC_015964	CCA	2	6	5012	5017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428594
106	NC_015964	AAT	2	6	5104	5109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428594
107	NC_015964	A	6	6	5159	5164	100 %	0 %	0 %	0 %	345428594
108	NC_015964	TAA	2	6	5181	5186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428594
109	NC_015964	TTA	2	6	5272	5277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428594
110	NC_015964	TAA	2	6	5295	5300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428594
111	NC_015964	TTA	2	6	5344	5349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428594
112	NC_015964	GA	4	8	5385	5392	50 %	0 %	50 %	0 %	345428594
113	NC_015964	AAT	2	6	5439	5444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428594
114	NC_015964	TAA	2	6	5450	5455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428594
115	NC_015964	CAA	2	6	5508	5513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428595
116	NC_015964	ATC	2	6	5626	5631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428595
117	NC_015964	CG	3	6	5678	5683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015964	ATC	2	6	5691	5696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015964	GTG	2	6	5786	5791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015964	TTC	2	6	5873	5878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015964	CGG	2	6	5908	5913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015964	CAATG	2	10	5930	5939	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015964	CAT	2	6	5960	5965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015964	GATG	2	8	6058	6065	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015964	TGC	2	6	6068	6073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015964	T	6	6	6175	6180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015964	GCT	2	6	6199	6204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015964	GAG	2	6	6311	6316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015964	AGT	2	6	6323	6328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015964	TA	3	6	6394	6399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015964	ATT	2	6	6405	6410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015964	ATG	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428596
133	NC_015964	ATT	2	6	6523	6528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428596
134	NC_015964	TA	4	8	6580	6587	50 %	50 %	0 %	0 %	345428596
135	NC_015964	AATT	2	8	6657	6664	50 %	50 %	0 %	0 %	345428596
136	NC_015964	AAG	2	6	6669	6674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428596
137	NC_015964	AT	3	6	6724	6729	50 %	50 %	0 %	0 %	345428596
138	NC_015964	A	6	6	6740	6745	100 %	0 %	0 %	0 %	345428596
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172	NC_015964	G	6	6	8275	8280	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
173	NC_015964	ATTAC	2	10	8286	8295	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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269	NC_015964	TAA	2	6	13035	13040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_015964	GAT	2	6	13209	13214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428602
274	NC_015964	TGG	2	6	13247	13252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345428602
275	NC_015964	TAAC	2	8	13330	13337	50 %	25 %	0 %	25 %	345428602
276	NC_015964	ATG	2	6	13390	13395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428602
277	NC_015964	AAC	2	6	13396	13401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428602
278	NC_015964	TTA	2	6	13407	13412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428602
279	NC_015964	A	6	6	13498	13503	100 %	0 %	0 %	0 %	345428602
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283	NC_015964	CTG	2	6	13651	13656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428602
284	NC_015964	CAA	2	6	13685	13690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428602
285	NC_015964	TTAA	2	8	13707	13714	50 %	50 %	0 %	0 %	345428602
286	NC_015964	GTT	2	6	13788	13793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428602
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295	NC_015964	TTC	2	6	14224	14229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428602
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299	NC_015964	ATT	2	6	14441	14446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428602
300	NC_015964	TGG	2	6	14490	14495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345428602
301	NC_015964	CTT	2	6	14519	14524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428602
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303	NC_015964	GTTTAG	2	12	14566	14577	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	345428602
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311	NC_015964	TGGA	2	8	14790	14797	25 %	25 %	50 %	0 %	345428602
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337	NC_015964	ATA	2	6	15536	15541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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383	NC_015964	T	6	6	17646	17651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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392	NC_015964	AT	3	6	17866	17871	50 %	50 %	0 %	0 %	345428606
393	NC_015964	CAA	2	6	17876	17881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428606
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398	NC_015964	T	6	6	18411	18416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
399	NC_015964	CAG	2	6	18431	18436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428607
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401	NC_015964	GAT	2	6	18510	18515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428607
402	NC_015964	CATT	2	8	18522	18529	25 %	50 %	0 %	25 %	345428607
403	NC_015964	TCATA	2	10	18627	18636	40 %	40 %	0 %	20 %	345428607
404	NC_015964	TGC	2	6	18703	18708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428607
405	NC_015964	T	6	6	18721	18726	0 %	100 %	0 %	0 %	345428607
406	NC_015964	CTT	2	6	18775	18780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428608
407	NC_015964	T	7	7	18797	18803	0 %	100 %	0 %	0 %	345428608
408	NC_015964	AT	3	6	18831	18836	50 %	50 %	0 %	0 %	345428608
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410	NC_015964	T	6	6	18899	18904	0 %	100 %	0 %	0 %	345428608
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424	NC_015964	ATA	2	6	19314	19319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428608
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432	NC_015964	AAT	2	6	19692	19697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428609
433	NC_015964	TAA	2	6	19716	19721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428609
434	NC_015964	ATT	2	6	19732	19737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428609
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436	NC_015964	AGCG	2	8	19778	19785	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
437	NC_015964	ATC	2	6	19832	19837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
438	NC_015964	CAT	2	6	19856	19861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
439	NC_015964	GCC	2	6	19875	19880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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441	NC_015964	TTG	2	6	20072	20077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
442	NC_015964	AAC	2	6	20130	20135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_015964	T	6	6	20141	20146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_015964	T	6	6	20161	20166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_015964	TGC	2	6	20196	20201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
446	NC_015964	TCT	3	9	20229	20237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
447	NC_015964	AAG	2	6	20250	20255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_015964	CAT	2	6	20282	20287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
450	NC_015964	CCA	2	6	20325	20330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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452	NC_015964	TAA	2	6	20348	20353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_015964	AAAC	2	8	20359	20366	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
454	NC_015964	ATT	2	6	20390	20395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_015964	TTG	2	6	20414	20419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
456	NC_015964	AAT	2	6	20433	20438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_015964	T	6	6	20440	20445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_015964	GTT	2	6	20461	20466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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460	NC_015964	T	6	6	20552	20557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_015964	TCT	2	6	20559	20564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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464	NC_015964	ATA	2	6	20628	20633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_015964	A	7	7	21092	21098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_015964	T	6	6	21106	21111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
478	NC_015964	TTCA	2	8	21171	21178	25 %	50 %	0 %	25 %	345428610
479	NC_015964	CTTG	2	8	21377	21384	0 %	50 %	25 %	25 %	345428610
480	NC_015964	CA	3	6	21439	21444	50 %	0 %	0 %	50 %	345428610
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486	NC_015964	TCA	2	6	21706	21711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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